四月十三日，国民党人在张园为宋教仁举行盛大的追悼会，当天到场人数近两万。
众多挽联中，黄兴所写的一副特别显眼前年杀吴禄贞，去年杀张振武，今年又杀宋教仁；你说是应桂馨，他说是洪述祖，我说确是袁世凯。
当天，黄兴因病未出席。
同样未出席的孙中山也送来一副挽联，曰作民权保障，谁非后死者；为宪法流血，公真第一人。
从挽联上看，黄兴的态度激烈而孙中山反显得平和，但背后的事实并非如此。
宋教仁遇刺案应该是民国第一大疑案。
巡捕房在应桂馨家中搜获凶器，以及密电码三本，封固函电证据两包，皮箱一个。
证据显示，应桂馨策划暗杀了宋教仁无疑，但谁又是应桂馨的背后指使呢？让我们来梳理一下。
第一个怀疑对象当然非袁世凯莫属，因为他有太多理由要杀宋教仁。
袁世凯曾经很欣赏宋教仁，并试图将他拉进自己的阵营中。譬如宋教仁在准备回湖南老家省亲时，袁世凯曾赠予其一本五十万元的交通银行支票，让宋教仁随意支用。可宋教仁除用了二三百元外，将支票基本原物退还。
另外，袁世凯还为宋教仁订造西装，连尺码都量得非常准确，足见其用心良苦。
可是，在袁世凯的如此用心地结交之下，宋教仁却是这样的“不识抬举”。他在各地演说中曾毫不忌讳地攻击袁世凯政府并言动一时，由此引起袁世凯的恼怒与仇恨，似乎也在情理之中。
如今，国民党在国会选举中获胜，宋教仁也即将成为一个难以对付的对手，袁世凯怎能不萌生杀意?
当然，如果真要是宋教仁组阁，对袁世凯还真的麻烦。因为，按《临时约法》当时的中华民国基本上是内阁制。袁世凯这个临时大总统，其实是个虚衔。
除掉了宋教仁，不就去了这个麻烦吗？
其次说赵秉钧，作为代理国务总理。赵秉钧杀人动机很简单，宋要来做总理了，赵往哪搁呢？
从应桂馨家搜出的密码本上注有“国务院”、“应密”、“民国二年一月十四日”等字样，而电文内容将矛头指向了国务院秘书洪述祖。
比如三月二十日半夜两点钟，即宋教仁被害之日，应桂馨致电洪述祖有“所发急电令已达到，请先呈报”等语。次日又致电洪述祖称“匪魁已灭，我军一无伤亡，堪慰，望转呈”。从上述证据来看，洪述祖涉案似乎是逃不掉的。
更重要的是，上面应的电报，均有“转呈候示”、“请先呈报”、“望转呈”。那么转呈的对象是谁？应桂馨与洪述祖的电文公之于众后，赵秉钧便成了刺杀宋教仁的另一最大嫌疑人。
还有陈其美杀宋教仁说。辛亥前，同盟会发生过两次倒孙风潮。在这两次倒孙风潮中，宋都没有站在孙一方。由此，陈其美等铁杆拥孙派对宋颇为怀恨。
南京临时政府成立后，宋与孙几乎处处唱反调。孙主北伐，宋主南北议和，推袁作总统。