1866年2月7日，清军对嘉应州展开大举围攻，谭体元率军抵抗，力战不支，遂弃城从西南门突围而走，突围而出的太平军在山高沟深的黄沙嶂迷路，兜兜转转，就是走不出去，耽误了宝贵的逃走时间。9日，楚军、霆军、绿营大举追至，双方旋即展开激战，清军人数众多，器械精良，太平军无力拒敌，全军溃败，偕王谭体元心知大势已去，遂闭目咬牙，拍马跳下悬崖自尽。不料坠崖后受伤未死，后来被清军捕获。太平军余部与清军一直血战到2月10日，几乎全军覆没，少数人向清军缴械投降，除偕王谭体元外，还有金王钟英、怀王周仕福、沛王谭标、宗王汪启贤、赞王赖阿养、烈王李海青等力竭被俘，悍将胡永祥、何明亮、黄矮子等人死战不屈，均被清军擒杀。后来，谭体元、钟英、周仕福、谭标、汪启贤、赖阿养等被俘人员（太平军余部诸王）皆被清军凌迟处死。自此，江南的太平军余党全部覆灭，太平军残余势力在南方的斗争也画上了句号（北方还有赖文光等人联合捻军在坚持战斗），洪秀全的太平天国到此基本结束。
1866年6月，开封魏府，一将来投，原来是傅忠信，清军攻嘉应州，他在奋勇拼杀中负伤晕死，后为百姓所救，一路乞讨来到开封，魏宣武与他换了衣服，又让他与古隆贤、杨辅清、吉庆元相见，送他入教导营学习。1866年7月，曾国藩集中湘军围剿捻军，左宗棠的楚军接纳降者甚多，见湘淮军皆败，就以浙江布政使蒋益澧率太平军降将丁太阳、黄朋厚、蔡元吉、邓光明部五万余人进攻安徽，想趁太平军立足未稳夺取安徽，李鸿章虽不情愿，奈何兵力不足，只好任其所为。
1866年7月21日，蒋益澧指挥各部清兵集中在湖州府，大张旗鼓进犯安徽广德州，另以丁太阳、黄朋厚部二十营一万余人从浙江开化县密入马金岭，想从休宁县进入徽州，直取徽州府城歙县，进而占据徽州府全境，作为攻取安徽省的立足点。徽州府太守阳谷、徽州府教士米嵩，徽州府提辖蔡昌龄接到探子密报，决心在马金岭设伏，吃掉丁太阳、黄朋厚这一万人马。马金镇地处开化县北部，马金地名有多种说法：一说以马氏、金氏始居得名，一说以马金岭得名。丁太阳、黄朋厚在马金镇歇息一宿，就往马金岭而去。马金岭古道是古徽州进入浙江衢州的必经之路，是休宁龙田及浙江开化一带居民和客商通往徽州的唯一官道，“十上十下十横”，单程三十里，马金岭，上十五里路，下十五里路，上下就有三十里路，路宽还不到一米，路边就是悬崖，马金岭是徽开古道中最险要路段，号称十上十下十横，是进出徽州南大门的一条天路。马金岭古道从石柱村的塘边店向东分叉，连接石川村的千米古道，这一连，竟连出了一个桃花源般的大峡谷。这就是麻坞村，剑石崖与剑石坞之间，百米宽的狭口，被一块荒地与溪流占去一大半。仅容一个多车位的通村路，启程了长达五公里的曲径通幽。麻坞村地域面积较大，有12.35平方公里，相当于原半个塘坞乡。大大小小山坞不计其数，曾有‘三十里香溪’之誉。马金岭北坡是一段横穿山背的道路，因处大山北面，常年阴湿，甚是湿滑，此处山势陡峭，十分险峻。徽州府提辖蔡昌龄早已提前带兵藏于麻坞村，教士米嵩则带附近三个乡屯一千余人守在古道最高点、海拔950米的垭口，垭口上有关隘，石墙高一米多，中有关门，关隘夹持于两峰间，南北山势险要，有一夫当关万夫莫开之势，历代兵家必争。
1866年8月4日，黄朋厚的前锋营五百余人已至关下，关上突地竖起太平军大旗，滚石擂木一齐砸下，关上枪炮齐鸣，一营清兵后退不及，竟然全部殒命。黄朋厚与丁太阳商议，既已被太平军发现，只有强攻关隘，于是用劈山小炮轰关，逼着清兵手持洋枪、鸟枪拼死攻关，伤亡了二千余人，攻了一天也没攻下。第二日，徽州府提辖蔡昌龄派兵突击其后，丁太阳忙用十营兵击，太平军退却，丁太阳猛追，不意各处山上往道上乱枪齐击，所有六磅小炮也不断轰击，丁太阳部大乱，中枪、中炮、坠崖者不计其数，清兵伤亡过半，余者皆降，丁太阳带少数兵蹿回关隘处，与黄朋厚带兵往来路冲回，待两人突出，所领兵又折损大半。丁太阳、黄朋厚只得灰溜溜地去见蒋益澧。蒋益澧正攻广德州不下，损失了二千多兵马，见丁太阳、黄朋厚只带一千多人逃回，知计不可行，就以各部紧守汛地，不再出战。左宗棠见状，只好派丁太阳等各招兵马，集攒力量，以图再举。